Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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