Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CHD4Q14839 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CHD4Q14839 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CHD4Q14839 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CHD4Q14839 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CHD4Q14839 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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