Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
COL4A6Q14031 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms