Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 SAMD3-204ENST00000439090 2093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
NEUROD1Q13562 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms