Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTP4A2Q12974 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms