Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
BPTFQ12830 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms