Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms