Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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AP3M2P53677 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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AP3M2P53677 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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AP3M2P53677 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
AP3M2P53677 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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