Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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PTPRMP28827 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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PTPRMP28827 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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PTPRMP28827 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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PTPRMP28827 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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