Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRAP18433 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRAP18433 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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