Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRCP08575 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRCP08575 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRCP08575 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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PTPRCP08575 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PTPRCP08575 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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PTPRCP08575 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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PTPRCP08575 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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PTPRCP08575 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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