Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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CLIP4Q8N3C7 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CLIP4Q8N3C7 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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