Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PCDH18-205ENST00000511115 1331 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AMELY-201ENST00000215479 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RBP2-201ENST00000232217 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNU1-11P-201ENST00000383975 164 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FCRL6-204ENST00000392235 947 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP94-201ENST00000411044 284 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01704-201ENST00000414848 834 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL139220.2-213ENST00000431800 674 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ASS1P11-201ENST00000441309 1216 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RN7SL856P-201ENST00000461754 298 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RFKP2-201ENST00000464555 477 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TCP10L-202ENST00000472557 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 IGKV1-16-201ENST00000479981 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RN7SL62P-201ENST00000498506 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AK4P2-201ENST00000504372 670 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC138466.2-201ENST00000540993 304 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MPPE1P1-201ENST00000557286 1076 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC135048.2-201ENST00000572471 561 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ELOF1-207ENST00000591674 679 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC011899.3-201ENST00000608596 617 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 FAM238B-204ENST00000612040 423 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MIR1273H-201ENST00000612921 116 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP002383.6-201ENST00000616726 697 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 PCBP1-AS1-243ENST00000458698 1893 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
ANKRD39Q53RE8 AP002026.1-201ENST00000500358 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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