Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CTXN3Q4LDR2 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms