Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PHBP4-201ENST00000437447 837 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC103855.4-201ENST00000533158 265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC016383.1-201ENST00000582700 714 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC226101.1-201ENST00000401483 387 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
VAMP3Q15836 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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