Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
RAB39AQ14964 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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