Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHD4Q14839 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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CHD4Q14839 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CHD4Q14839 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CHD4Q14839 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CHD4Q14839 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CHD4Q14839 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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