Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
GTF2H3Q13889 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
GTF2H3Q13889 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms