Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
DUSP4Q13115 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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