Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CHAF1AQ13111 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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CHAF1AQ13111 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CHAF1AQ13111 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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