Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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