Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms