Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC011483.4-201ENST00000623621 585 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL133230.1-201ENST00000431019 4587 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CALCOCO2-201ENST00000258947 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ABL2-206ENST00000504405 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 GUCY1A3-208ENST00000511507 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CCDC15-201ENST00000344762 3893 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL445933.1-201ENST00000434240 2242 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CTNND2-205ENST00000503622 2982 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 OR51D1-202ENST00000641817 3561 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 NBPF19-204ENST00000611931 2051 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 NBPF26-205ENST00000615219 2051 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 NBPF12-207ENST00000617864 2051 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 NBPF20-204ENST00000620821 2051 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC104825.2-201ENST00000505448 3249 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LY9-203ENST00000368037 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ALMS1-204ENST00000484298 12595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 MAGEE1-201ENST00000361470 3630 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AMPH-201ENST00000325590 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LOXHD1-212ENST00000582408 3755 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SLFN12-206ENST00000452764 2423 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 MTCP1-201ENST00000362018 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RN7SKP110-201ENST00000410146 285 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SNRPGP11-201ENST00000411777 232 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL365295.1-204ENST00000425648 553 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC011998.2-201ENST00000430884 473 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 TUBB3P2-201ENST00000480063 232 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 GRHL1-206ENST00000480736 572 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AP001973.1-201ENST00000530177 572 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC127029.1-201ENST00000560822 237 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC137800.1-202ENST00000562098 446 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SLC9A6-207ENST00000636092 4697 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC008895.1-201ENST00000624074 2622 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LINC02009-201ENST00000635852 2951 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 FBXO38-203ENST00000394370 4132 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 NRP1-212ENST00000432372 4137 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 DNAH11-201ENST00000328843 13917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CASC15-203ENST00000605917 4461 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CD36-209ENST00000435819 2365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 DHRS9-201ENST00000357546 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 INTS7-201ENST00000366992 3380 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 FBXW7-204ENST00000393956 1735 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 IQCH-AS1-203ENST00000559298 5753 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 GFM2-207ENST00000509430 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 CDK15-202ENST00000410091 1780 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RN7SKP10-201ENST00000364291 325 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 BPIFA1-202ENST00000375413 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RNA5SP209-201ENST00000411237 97 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LINC02090-201ENST00000419151 400 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RN7SL316P-201ENST00000483452 272 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RPL36P16-201ENST00000496996 306 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 IGHVII-15-1-201ENST00000517931 220 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC022880.2-201ENST00000532664 270 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC005871.2-201ENST00000549104 526 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 LINC02301-202ENST00000555150 428 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
CACNB1Q02641 AP000915.2-201ENST00000582120 454 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms