Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
E2F1Q01094 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms