Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD13P35453 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD13P35453 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD13P35453 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD13P35453 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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HOXD13P35453 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
HOXD13P35453 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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