Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PTPRGP23470 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPRGP23470 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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