Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 LINC01837-206ENST00000636649 1056 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CCDC38Q502W7 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms