Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
BBS9Q3SYG4 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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