Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
COL24A1Q17RW2 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms