Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CA9Q16790 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CA9Q16790 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CA9Q16790 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CA9Q16790 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CA9Q16790 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CA9Q16790 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CA9Q16790 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CA9Q16790 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms