Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CDKN3Q16667 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CDKN3Q16667 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
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