Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PUM3Q15397 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms