Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL4A6Q14031 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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COL4A6Q14031 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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COL4A6Q14031 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
COL4A6Q14031 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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