Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ITGA9Q13797 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ITGA9Q13797 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms