Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTCH1Q13635 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
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