Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SPATA9-201ENST00000274432 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TOP3AQ13472 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms