Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ESRRG-222ENST00000493748 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 TTC26-202ENST00000430935 4198 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 SULT1C2-201ENST00000251481 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 NBPF25P-201ENST00000606775 2019 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 MIR146B-201ENST00000365699 73 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 RPL15P1-201ENST00000439981 600 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 NPPA-AS1-202ENST00000446542 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC026254.1-201ENST00000479473 431 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 GUSBP3-201ENST00000509348 423 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC123788.1-201ENST00000526922 783 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AL132855.1-201ENST00000557368 207 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 AC090415.1-201ENST00000581877 847 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 AC087885.1-201ENST00000641910 848 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 MKNK1-AS1-201ENST00000602433 2445 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 AL133230.1-201ENST00000431019 4587 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN4PQ13434 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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MKRN4PQ13434 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 TRIM55-204ENST00000353317 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 MRPS27-202ENST00000457646 2628 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN4PQ13434 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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