Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CDADC1-201ENST00000251108 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC00907-205ENST00000589068 1812 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 WWC3-AS1-201ENST00000430057 578 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CASC11-203ENST00000519071 791 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC025524.2-202ENST00000523042 535 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CACNB4-219ENST00000636108 1698 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MTPN-201ENST00000393085 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL17P17-201ENST00000419491 557 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL354714.5-201ENST00000450131 590 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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