Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
GRIK2Q13002 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
GRIK2Q13002 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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