Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
E2F1Q01094 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms