Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PGGT1BP53609 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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PGGT1BP53609 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PGGT1BP53609 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PGGT1BP53609 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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