Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 GMDS-AS1-202ENST00000505870 8217 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TLN2-211ENST00000636159 7441 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR2M4-202ENST00000641868 5934 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PKHD1P08F94 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms