Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CEP290O15078 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CEP290O15078 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CEP290O15078 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CEP290O15078 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CEP290O15078 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CEP290O15078 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CEP290O15078 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CEP290O15078 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CEP290O15078 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CEP290O15078 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CEP290O15078 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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