Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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