Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 STK32A-202ENST00000397936 5393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
FOXQ1Q9C009 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms