Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRAPPC9Q96Q05 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms