Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ACYP1-204ENST00000555135 639 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL353807.4-201ENST00000604995 257 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TRMT13-203ENST00000370143 476 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC01262-201ENST00000513681 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
VAMP3Q15836 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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