Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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