Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SIX1Q15475 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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SIX1Q15475 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
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SIX1Q15475 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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