Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PUM3Q15397 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PUM3Q15397 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PUM3Q15397 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PUM3Q15397 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PUM3Q15397 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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PUM3Q15397 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PUM3Q15397 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PUM3Q15397 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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PUM3Q15397 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
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PUM3Q15397 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
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